MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptosporangium roseum DSM 43021 plasmid pSROS01

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013596	AGGGA	2	10	36	45	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013596	CGTG	2	8	2579	2586	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013596	GTG	2	6	2590	2595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013596	GC	3	6	2607	2612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013596	CCG	2	6	2714	2719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013596	CGGGC	2	10	2788	2797	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013596	CGCGC	2	10	2814	2823	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_013596	CGGG	2	8	2829	2836	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013596	GCGGGG	2	12	3340	3351	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013596	G	6	6	3348	3353	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013596	GCTT	2	8	10218	10225	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013596	TCG	2	6	10259	10264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013596	ACG	2	6	10266	10271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013596	TCG	2	6	10274	10279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013596	GGA	2	6	10308	10313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013596	TCG	2	6	10324	10329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013596	GC	3	6	11139	11144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013596	GC	3	6	11415	11420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013596	GC	3	6	11438	11443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013596	GGGC	2	8	11542	11549	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013596	GACC	2	8	11564	11571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013596	GTG	2	6	11691	11696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013596	TTC	2	6	11718	11723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013596	CCA	2	6	11763	11768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_013596	AC	3	6	12130	12135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013596	CCG	2	6	12203	12208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_013596	GTA	2	6	12237	12242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013596	TGT	2	6	12321	12326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013596	CTC	2	6	12392	12397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013596	TAC	2	6	12434	12439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013596	CCTC	2	8	12456	12463	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_013596	TCG	2	6	12477	12482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013596	GAAC	2	8	12501	12508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013596	TGA	2	6	12561	12566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013596	CGG	2	6	12592	12597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013596	GGC	2	6	12599	12604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013596	GCCC	2	8	12615	12622	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_013596	C	6	6	12620	12625	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_013596	TCA	2	6	12698	12703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013596	AGG	2	6	12705	12710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013596	GCG	2	6	14494	14499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013596	AGC	2	6	15104	15109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013596	CAGG	2	8	15121	15128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013596	AGG	2	6	15194	15199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013596	CGG	2	6	15229	15234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013596	GGCT	2	8	15264	15271	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013596	TTCG	2	8	15281	15288	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013596	AG	3	6	15574	15579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013596	GCCCG	2	10	15585	15594	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_013596	GCC	2	6	15597	15602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013596	GGC	2	6	15605	15610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013596	CCA	2	6	15656	15661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013596	CTT	2	6	15713	15718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013596	TGA	2	6	15720	15725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013596	GGA	2	6	15784	15789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013596	CGA	2	6	15794	15799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013596	TGG	2	6	15809	15814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013596	CGG	2	6	15830	15835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013596	TGA	2	6	15842	15847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013596	GGC	2	6	15882	15887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013596	AT	3	6	17889	17894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013596	CT	3	6	17912	17917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013596	GCG	2	6	18926	18931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013596	TACC	2	8	18974	18981	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013596	CGG	2	6	19064	19069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013596	CTC	2	6	19087	19092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013596	GGT	2	6	19113	19118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013596	TGACG	2	10	19187	19196	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013596	GAC	2	6	20073	20078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013596	AGCC	2	8	20109	20116	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013596	TGT	2	6	20126	20131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013596	GAT	2	6	20164	20169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013596	GAT	2	6	20284	20289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013596	TGC	2	6	20300	20305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013596	GC	3	6	20363	20368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013596	CAG	2	6	20395	20400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013596	CTGGC	2	10	20410	20419	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_013596	CGA	2	6	20521	20526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013596	TC	3	6	20528	20533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013596	TGGT	2	8	20551	20558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013596	TCG	2	6	20561	20566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013596	AGCG	2	8	20638	20645	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013596	ACT	2	6	20683	20688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013596	GTC	2	6	20697	20702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013596	GCT	2	6	20779	20784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013596	CAG	3	9	20787	20795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013596	CG	3	6	20804	20809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013596	AAT	2	6	20913	20918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013596	CGG	2	6	20961	20966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013596	CCG	2	6	20974	20979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013596	TGG	2	6	20999	21004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013596	GAA	2	6	21036	21041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013596	ACC	2	6	21367	21372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_013596	CTG	2	6	21384	21389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013596	GT	3	6	21403	21408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013596	CTA	2	6	21419	21424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013596	GGC	2	6	21431	21436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013596	GCG	2	6	21443	21448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013596	TGA	2	6	21518	21523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013596	CAC	2	6	21653	21658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_013596	CG	3	6	21670	21675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013596	GAG	2	6	21717	21722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013596	ACGT	2	8	21750	21757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013596	GGT	2	6	21788	21793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013596	TCT	2	6	21802	21807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013596	TCG	2	6	21817	21822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013596	CAC	2	6	21915	21920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_013596	G	6	6	21929	21934	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013596	GCAG	2	8	21971	21978	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013596	CTT	2	6	22032	22037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013596	CGC	2	6	22138	22143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013596	CCG	2	6	22172	22177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_013596	TGC	2	6	22224	22229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013596	GGTG	2	8	22296	22303	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013596	CGAA	2	8	22380	22387	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013596	CTTGAT	2	12	22500	22511	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013596	TCG	2	6	22570	22575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013596	ATC	2	6	22621	22626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013596	AGA	2	6	22628	22633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013596	CCT	2	6	22640	22645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013596	ATC	2	6	22682	22687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013596	ACG	2	6	22717	22722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013596	GGA	2	6	24118	24123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013596	GTG	2	6	24131	24136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013596	GTG	2	6	24171	24176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013596	GCT	2	6	24191	24196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013596	TCG	2	6	24198	24203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013596	TACA	2	8	24214	24221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013596	GGC	2	6	24249	24254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013596	CTTT	2	8	24325	24332	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013596	CA	3	6	24490	24495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013596	AC	3	6	24542	24547	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013596	GC	4	8	24616	24623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013596	CAG	2	6	24629	24634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013596	CGT	2	6	24638	24643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013596	TGC	2	6	24693	24698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013596	GTC	2	6	24725	24730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013596	TCG	2	6	24772	24777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013596	GGC	2	6	24829	24834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013596	ATC	2	6	24850	24855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013596	GGT	2	6	26509	26514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013596	CGGGTG	2	12	26527	26538	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_013596	TGG	2	6	27785	27790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013596	GC	3	6	27799	27804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013596	GC	3	6	27842	27847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013596	GGT	2	6	28084	28089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013596	G	6	6	28110	28115	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013596	G	6	6	28132	28137	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013596	TGG	2	6	28144	28149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013596	CGA	2	6	28159	28164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013596	TCG	2	6	28174	28179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.